Después de su lanzamiento en 1999, el lugar de The Matrix en la cultura ha sido ampliamente reconocido, pero las similitudes entre la película y el cómic Los Invisibles de Grant Morrison han permanecido en discusión durante años. Morrison afirma que los hermanos Wachowski les entregaron dos libros a su equipo de producción como referencias, uno de los cuales es Los Invisibles. Los hermanos Wachowski no han emitido una declaración oficial de aprobación ni de rechazo sobre esta afirmación.