Waseda Üniversitesi Bilim ve Mühendislik Fakültesi'nden Hitoshi Iuchi ve Michiaki Hamada liderliğindeki bir ekip, tek hücre RNA dizilemesi (scRNA‑seq) verilerinde pseudotime’e bağlı farklı olarak eksprese edilen genleri tespit etmeye yönelik scLS adlı yeni bir algoritma geliştirdi ve bu çalışmayı Nucleic Acids Research dergisinde yayımladı.

scLS, düzensiz örneklenmiş zaman serileri için tasarlanmış Lomb‑Scargle periyodogramını kullanarak gen ifadelerini frekans alanına dönüştürüyor; bu sayede hem dinamik hem de koşullar arası kaydırılmış ifade modelleri, açık bir regresyon ya da dal dallandırma eşleştirmesi gerektirmeden analiz edilebiliyor. Simülasyon ve gerçek veri setlerinde algoritma, geleneksel yöntemlerle benzer doğruluk sunarken işlem süresinde belirgin bir tasarruf sağladı.

Yöntem, ifadelerin hangi dal ya da hat üzerinde gerçekleştiğini doğrudan belirleyemediği için, daha ayrıntılı hat‑odaklı analizlerle tamamlanması öneriliyor; yine de hücre farklılaşması, bağışıklık aktivasyonu ya da ilaç yanıtı gibi geniş kapsamlı tek hücre çalışmaları için hızlı bir ön tarama aracı olarak kullanılabilir.