The Callisto Protocol, Krafton tarafından Striking Distance studios'unda geliştirilerek $100 milyon bütçeyle piyasaya sürülmüş olsa da, oyunun çıkışı Covid-19 pandemisi sırasında yapıldı. Oyun yaratıcısı Glen Schofield, oyunun 'zorla çıkarılarak' (forced to ship) satıma sunulduğunu ve pandemin takım sağlığına büyük etkisi olduğunu vurguladı; geliştirme sürecinde şirkette aylık dört ile altı çalışan hastalığa yakalandı.
Stüdyo'da yaşanan sağlık krizleri, rendering ekibinin ara sürelerde kapatılması ve oyun geliştirme sürecindeki ikincil önceliğin sağlığa kaybetmesiyle değiştirilmesiyle sonuçlandı. Oyunun başlangıçta framerate stuttering sorunları nedeniyle olumsuz eleştiriler almasına rağmen, geliştirici ekstra yamalar ve bölümler eklemek için 86 yama yayınladı.
Bu zorlu süreç sonucu stüdyoda Ağustos 2023'te ve Şubat 2025'te kitlek istifa gerçekleşti; Schofield 2026'da videoy oyun sektöründen pensiyona geçti ve 'muhtemelen son oyunumu yönettiğimi' ifade etti.