Anime News Networkのライター、Sylvia Jones氏が『生徒会にも穴はある！』第6話をレビューし、トイレコメディ要素がいかにキャラクター主導のユーモアと融合しているかを分析している。久賀、駒郎、有栖がトイレの個室で遭遇する恥ずかしい事態が、それぞれの個性を反映した独自のコミカルなシナリオへと展開する。

筆者は、本作が確かなコメディと印象的なアニメーションに加え、倒錯的な要素も含んでいると指摘。里見先生というキャラクターの大人としてのテーマと性的描写が、生徒キャラクターとは異なる「よりリアルな」トーンで提示されている。

窓からの転落事故をきっかけに久賀が自身の性的アイデンティティと向き合う過程が、「めったに見られない正直な女性の性の肖像」として評価されている点が強調される。また、駒郎の両親不在での成長と孤独が、カラーパレットの変化を通じて表現されている。