Atari TOS fue uno de los sistemas operativos importantes de la era de 16 bits. Ahora, el sistema operativo de código abierto llamado EmuTOS se ha ejecutado en la consola Sega Mega CD.
Este proyecto añade soporte de teclado serial, impresora y audio a la consola. Además, después de arrancar desde CD o cartucho, permite el acceso a un disco RAM, a la RAM de respaldo interna y a la RAM de guardado de cartuchos.
Se planea portar también el paquete de software GEOS a la plataforma. Sin embargo, aún no hay imágenes disponibles, por lo que se desconoce si funciona correctamente.