BepiColombo uzay aracı, Merkür'ün inişini başarıyla başlattıktan sonra, propulsion stage'dan ayrılarak orbital insertion için hazırlanmıştır. Sekiz yıl süren yolculuk sonrasında, araç 3 Eylül'te propulsion stage'dan ayrıldı ve orbital insertion adımlarına başladı. Bu ayrıma, araçta kullanılan Mercury Transfer Module (MTM) ion sürücüsüyle yapılan ateşleme ve pyrotechnik bağlantıların yakılmasıyla sağlandı.

Operatörler, 11 dakika gecikmeyi göz önünde bulundurarak, 200 milyon kilometre uzaktaki araca radyo sinyali göndermişlerdir. Ayrıma sonradan alıcıların, MTM ve geri kalan kısım arasında Doppler kayması gösteren hafif bir sinyal değişikliğiyle başarılı olduğunu onaylamışlardır.

Ayrıma sonrası, yol devam edecek kısım sistemlerini dağıttı ve güneş enerjisiyle gücünü sağlamaya başladı. Bu araç, ESA ve Japon Uzay Ajansı (JAXA) ortaklığıyla yapılmıştır; ESA'nın Merkür Kumsal Orbiter'i (MPO) ve Japon'un Merkür manyetik alan Orbiter'i (Mio) olmak üzere iki ayrı orbiter içerir.