バイオディーゼルは環境に優しい燃料として注目を集めているが、高コスト、エネルギー効率の低下、寒冷地でのゲル化などの欠点を抱えている。バイオディーゼルは植物油や動物油などの生物由来の資源から製造され、従来のディーゼル燃料に比べてクリーンな燃焼を実現する。しかし、B100のような高比率のバイオディーゼル混合燃料は、従来のディーゼル燃料よりも約10%高価であり、同じ量の燃料で走行できる距離が短くなる可能性がある。

バイオディーゼルは寒冷地でゲル化しやすく、不適切な保管条件下では酸化のリスクを伴う。これは燃料システム内の金属部品を腐食させ、燃料を使用不能にする可能性がある。また、高比率のバイオディーゼル混合燃料は、従来のディーゼル燃料システムに適しておらず、特別な装置を必要とする。

バイオディーゼルは環境に優しい代替燃料であるが、生産コストやエネルギー効率などの課題に直面している。バイオディーゼルは植物由来の資源から製造されるため、土地利用の変化を直接または間接的に引き起こす可能性があり、環境への影響は議論の的となっている。