2026年に勢いを増したエルニーニョは、赤道太平洋の海洋食物連鎖に顕著な乱れを引き起こした。NASAの衛星観測では、中部太平洋における表層クロロフィル濃度が、前年の中性条件と比べて大幅に低下したことが記録された。

専門家は、東西の貿易風が弱まることで温暖な表層水が深層へと拡がり、栄養豊富な冷水が表層に上がりにくくなる、すなわち湧昇が減速し、栄養供給が減少すると指摘している。この結果、植物プランクトンが減少し、続いて動物プランクトン、魚類、海鳥、哺乳類の餌不足を招く。NOAAは、エルニーニョが2027年初頭まで続く確率を90％超と見積もっている。

過去のエルニーニョ期では、事象が終わるとクロロフィル濃度が再び上昇した。海流や南米から供給される鉄塵がこの回復を支えている。Limは、全体的な生態系像を得るために表層と深層の測定を統合すべきだと強調している。