Un equipo liderado por Hitoshi Iuchi y Michiaki Hamada, de la Facultad de Ciencia e Ingeniería de la Universidad Waseda, desarrolló un nuevo algoritmo llamado scLS para identificar genes diferencialmente expresados en función del pseudotiempo en datos de secuenciación de ARN de una sola célula (scRNA‑seq), y publicó este trabajo en la revista Nucleic Acids Research.
scLS utiliza el periodograma Lomb‑Scargle, diseñado para series temporales muestreadas de forma irregular, para transformar la expresión génica al dominio de la frecuencia; de este modo, tanto los modelos de expresión dinámicos como los desplazados entre condiciones pueden analizarse sin requerir una regresión explícita ni un emparejamiento de ramificación. En simulaciones y conjuntos de datos reales, el algoritmo ofrece una precisión comparable a los métodos tradicionales, al tiempo que logra una reducción notable del tiempo de procesamiento.
Dado que el método no puede determinar directamente en qué rama o trayectoria ocurre la expresión, se recomienda complementarlo con análisis más detallados centrados en la rama; sin embargo, puede emplearse como una herramienta de cribado rápido en estudios de una sola célula de gran alcance, como diferenciación celular, activación inmunológica o respuesta a fármacos.