EMBL Heidelberg'in Krebs Grubu, hücrelerin hangi genleri ne zaman aktif edeceğini belirleyen mekanizmaları anlamak için yeni bir genetik araç geliştirdi. Bu araç, araştırmacıların yüzlerce düzenleyici DNA dizisini genomun belirli bir konumuna yerleştirip, bunların gen düzenleme üzerindeki etkilerini tek tek incelemelerini sağlıyor. Bu sayede, küçük dizisel değişikliklerin gen düzenleme üzerindeki etkileri, karıştırıcı faktörler kontrol altında tutularak test edilebiliyor.

Araştırmacılar, bu yöntemle transkripsiyon faktörlerinin etkilerini daha iyi anlamaya çalışıyorlar. Çalışmalarında, transkripsiyon faktörlerinin birden fazla birleştiğinde, tek başlarına yapabileceklerinden çok daha fazla etki yaratabildiklerini gözlemlediler. Bu, birden fazla notun bir sayfaya yapıştırılması, o sayfanın açılma olasılığını artırması gibi bir etkiye benziyor.

Yöntem, tek hücre düzeyinde DNA dizileri ve epigenetik işaretlerin değişimlerini incelemek için tek molekül izlenme yöntemini kullanıyor. Bu yöntem, FootprintCharter adlı yeni bir hesaplama çerçevesi ile destekleniyor. Krebs, bu yöntemlerin karmaşıklığı yönetilebilir parçalara ayırarak, DNA dizisinden gen düzenlemeye kadar olan kuralları anlamaya yardımcı olacağını söylüyor.