The Sinking City 2は、前作とは異なり、オープンなサバイバルホラーとして設計されている。Frogwaresは、探偵ゲームの「発見、ヒントを探す、推論する」サイクルとサバイバルホラーの「発見、敵と対決する、安全な場所に戻る」サイクルを統合するのではなく、調査メカニズムをコアサイクルから外し、二次的なレイヤーに移行させている。

ヒントを結びつけるシステムは、プレイヤーが最も好きな機能であるため保持されており、しかし、ヒントの欠如が物語の進行を妨げることを防ぐために、オプションとして実装されている。

オプションの調査は、より安全なルート、補給、強化などで報酬される。