ドナルド・トランプが子供のワクチン接種回数を減らすためにMMRワクチンを3つの別々の注射に分割する命令は、製薬会社からも強い反発を受けた。PhRMA、GSK、ファイザーなどの大手企業を代表する製薬業界団体は、この命令に科学的根拠がなく、米国のワクチン政策を損なうとして非難した。現在のMMRワクチンの組み合わせ型は、数十年にわたるデータで非常に安全で効果的、かつ実用的であることが証明されている。

トランプの命令を実行するためには、製薬会社が新しいワクチンを開発し、テストし、市場に出すために巨額の投資が必要となる。しかし、この投資は科学的根拠がなく行われるものであり、現在米国では単独で使用される麻疹、風疹、おたふくかぜのワクチンは存在しない。そのため、命令の実行は実践的にも不可能に見える。

トランプの命令は、医療・医学界からも強い批判を受けた。アメリカ小児科学会は、この命令が単に失望を与えるだけでなく、子供たちの健康を危険にさらす一歩であると指摘した。同学会は、トランプと保健大臣のロバート・F・ケネディ・ジュニアの科学的根拠のない反ワクチン政策に対し、訴訟も起こしている。